单细胞基因组测序技术是在单细胞水平对全基因组进行扩增与测序的一项新技术。其原理是对分离的单细胞中微量全基因组DNA进行高效扩增,获得高覆盖率的完整的基因组后进行高通量测序,用于揭示细胞群体差异和细胞进化关系。
极客基因使用改进后的扩增技术,具有低偏倚性特点,扩增更均匀,因而更能准确精细地判定细胞是否存在拷贝数变异。
对单细胞基因组的数据化窗口进行分析,在10Mb分辨率下,可完整展示单个细胞内基因组CNVs。
MDA,多重置换扩增,是一种等温的链置换扩增反应,其使用随机的6碱基引物在多位点和模板链结合,接着利用phi29DNA聚合酶很强的模板结合和置换能力实现对全基因组的扩增。MALBAC,基于多次退火和成环的扩增循环,通过采用特殊引物,使得扩增子的结尾互补而成环,从而达到近乎线性的扩增。 两种扩增方法各有优势,检测CNV时候MALBAC比较有优势,检测点突变(SNV)时候MDA比较有优势。
可以,但效果不好