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单细胞基因组测序

产品介绍

       单细胞基因组测序技术是在单细胞水平对全基因组进行扩增与测序的一项新技术。其原理是对分离的单细胞中微量全基因组DNA进行高效扩增，获得高覆盖率的完整的基因组后进行高通量测序，用于揭示细胞群体差异和细胞进化关系。
       极客基因使用改进后的扩增技术，具有低偏倚性特点，扩增更均匀，因而更能准确精细地判定细胞是否存在拷贝数变异。

技术流程

部分结果展示

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对单细胞基因组的数据化窗口进行分析，在10Mb分辨率下，可完整展示单个细胞内基因组CNVs。

送样要求

一、
分离的单细胞放入公司提供的裂解液中，使用干净的无核酸酶的200µlPCR管，每管裂解液用量为5µl，放入细胞时带入缓冲液体积不要超过1µl。
二、
每种细胞建议3-5个细胞做重复。
三、
单细胞放入裂解液后，-80℃保存，干冰运输。运输的时候要将管子做好包装，放入干冰中，以防运输过程中管子损坏。
四、
裂解液-80℃保存，避免反复冻融。
五、
操作过程尽量保持低温环境，加入单细胞的裂解液尽快放入-80℃保存，最好不要超过1小时，中间的时间越短越好。
六、
样本一旦放在-80℃或干冰冻存之后，不能反复化冻。

常见问题

单细胞基因组测序用MDA或MALBAC技术有什么不同，有什么优缺点？

MDA，多重置换扩增，是一种等温的链置换扩增反应，其使用随机的6碱基引物在多位点和模板链结合，接着利用phi29DNA聚合酶很强的模板结合和置换能力实现对全基因组的扩增。MALBAC，基于多次退火和成环的扩增循环，通过采用特殊引物，使得扩增子的结尾互补而成环，从而达到近乎线性的扩增。 两种扩增方法各有优势，检测CNV时候MALBAC比较有优势，检测点突变（SNV）时候MDA比较有优势。

单细胞基因组测序能同时看SNP和CNV吗?

可以，但效果不好